MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 60313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_013205	CGT	2	6	123292	123297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510123
2502	NC_013205	GCT	2	6	123322	123327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510123
2503	NC_013205	CAAC	2	8	123328	123335	50 %	0 %	0 %	50 %	258510123
2504	NC_013205	AC	3	6	123334	123339	50 %	0 %	0 %	50 %	258510123
2505	NC_013205	GAC	2	6	123412	123417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510123
2506	NC_013205	TCC	2	6	123429	123434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510123
2507	NC_013205	AGC	2	6	123444	123449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510123
2508	NC_013205	CGA	2	6	123472	123477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510123
2509	NC_013205	TGA	2	6	123495	123500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510123
2510	NC_013205	CTG	2	6	123545	123550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510123
2511	NC_013205	CGA	2	6	123622	123627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510123
2512	NC_013205	ATG	2	6	123701	123706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510123
2513	NC_013205	TCGCGC	2	12	123775	123786	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	258510123
2514	NC_013205	GAA	2	6	123788	123793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510123
2515	NC_013205	TAC	2	6	123839	123844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510123
2516	NC_013205	CGG	2	6	123937	123942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510123
2517	NC_013205	ACG	2	6	123974	123979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510123
2518	NC_013205	TCG	3	9	124007	124015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510123
2519	NC_013205	GTC	2	6	124039	124044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510123
2520	NC_013205	GCG	2	6	124081	124086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510124
2521	NC_013205	GC	3	6	124211	124216	0 %	0 %	50 %	50 %	258510124
2522	NC_013205	CGC	2	6	124226	124231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510124
2523	NC_013205	GCGG	2	8	124259	124266	0 %	0 %	75 %	25 %	258510124
2524	NC_013205	CGAGAT	2	12	124277	124288	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	258510124
2525	NC_013205	GCG	2	6	124374	124379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510124
2526	NC_013205	GCG	2	6	124420	124425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510124
2527	NC_013205	GC	4	8	124479	124486	0 %	0 %	50 %	50 %	258510124
2528	NC_013205	CCA	2	6	124527	124532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510124
2529	NC_013205	GGC	2	6	124536	124541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510124
2530	NC_013205	GCG	2	6	124544	124549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510124
2531	NC_013205	CGA	2	6	124553	124558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510124
2532	NC_013205	ACG	2	6	124570	124575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510124
2533	NC_013205	CCG	2	6	124601	124606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510124
2534	NC_013205	ACG	2	6	124615	124620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510124
2535	NC_013205	GAG	2	6	124650	124655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510124
2536	NC_013205	CG	3	6	124889	124894	0 %	0 %	50 %	50 %	258510125
2537	NC_013205	GCAT	2	8	124981	124988	25 %	25 %	25 %	25 %	258510125
2538	NC_013205	CG	3	6	125004	125009	0 %	0 %	50 %	50 %	258510125
2539	NC_013205	GA	3	6	125068	125073	50 %	0 %	50 %	0 %	258510125
2540	NC_013205	CGC	2	6	125152	125157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510125
2541	NC_013205	GAA	3	9	125224	125232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510125
2542	NC_013205	CTC	2	6	125285	125290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510125
2543	NC_013205	GGA	2	6	125299	125304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510125
2544	NC_013205	GCC	2	6	125305	125310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510125
2545	NC_013205	TTGT	2	8	125321	125328	0 %	75 %	25 %	0 %	258510125
2546	NC_013205	CCA	2	6	125334	125339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510125
2547	NC_013205	CAT	2	6	125365	125370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510125
2548	NC_013205	CGATT	2	10	125384	125393	20 %	40 %	20 %	20 %	258510125
2549	NC_013205	CCG	2	6	125395	125400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510125
2550	NC_013205	GCGCCT	2	12	125425	125436	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	258510125
2551	NC_013205	GGC	2	6	125481	125486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510125
2552	NC_013205	CGCGCT	2	12	125518	125529	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	258510125
2553	NC_013205	GGC	3	9	125539	125547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510125
2554	NC_013205	TGG	2	6	125589	125594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510125
2555	NC_013205	GTG	2	6	125732	125737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510125
2556	NC_013205	GCT	2	6	125845	125850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510125
2557	NC_013205	GCC	2	6	125852	125857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510125
2558	NC_013205	GAC	2	6	125963	125968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510125
2559	NC_013205	CGG	2	6	125976	125981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510125
2560	NC_013205	GC	3	6	125996	126001	0 %	0 %	50 %	50 %	258510125
2561	NC_013205	GCC	3	9	126008	126016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510125
2562	NC_013205	CGG	2	6	126017	126022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510125
2563	NC_013205	AGC	2	6	126039	126044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510125
2564	NC_013205	CCGCCC	2	12	126150	126161	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	258510125
2565	NC_013205	ATCGCG	2	12	126204	126215	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258510125
2566	NC_013205	ACGC	2	8	126290	126297	25 %	0 %	25 %	50 %	258510125
2567	NC_013205	CGC	2	6	126330	126335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510125
2568	NC_013205	GC	3	6	126334	126339	0 %	0 %	50 %	50 %	258510125
2569	NC_013205	GTG	2	6	126341	126346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510125
2570	NC_013205	CGG	2	6	126390	126395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510125
2571	NC_013205	CG	3	6	126398	126403	0 %	0 %	50 %	50 %	258510125
2572	NC_013205	GAG	2	6	126476	126481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510125
2573	NC_013205	GCG	2	6	126485	126490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510125
2574	NC_013205	CG	3	6	126525	126530	0 %	0 %	50 %	50 %	258510125
2575	NC_013205	GAC	2	6	126617	126622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510125
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2578	NC_013205	CGG	2	6	126722	126727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510126
2579	NC_013205	GCG	3	9	126728	126736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510126
2580	NC_013205	GTG	2	6	126769	126774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510126
2581	NC_013205	CGT	2	6	126795	126800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510126
2582	NC_013205	TCG	2	6	126878	126883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510126
2583	NC_013205	AAG	2	6	126884	126889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510126
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2585	NC_013205	CG	3	6	127016	127021	0 %	0 %	50 %	50 %	258510127
2586	NC_013205	GATC	2	8	127082	127089	25 %	25 %	25 %	25 %	258510127
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2588	NC_013205	CGT	2	6	127190	127195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510127
2589	NC_013205	CG	3	6	127231	127236	0 %	0 %	50 %	50 %	258510127
2590	NC_013205	TGC	2	6	127258	127263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510127
2591	NC_013205	ATTCGG	2	12	127305	127316	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	258510127
2592	NC_013205	CCA	2	6	127366	127371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510127
2593	NC_013205	AGGCG	2	10	127385	127394	20 %	0 %	60 %	20 %	258510127
2594	NC_013205	GCG	2	6	127471	127476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510127
2595	NC_013205	GGCG	2	8	127525	127532	0 %	0 %	75 %	25 %	258510127
2596	NC_013205	TCA	2	6	127675	127680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510128
2597	NC_013205	TCA	2	6	127726	127731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510128
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2600	NC_013205	TC	3	6	127809	127814	0 %	50 %	0 %	50 %	258510128
2601	NC_013205	GCC	2	6	127827	127832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510128
2602	NC_013205	ATC	2	6	127842	127847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510128
2603	NC_013205	GTT	2	6	127856	127861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510128
2604	NC_013205	GTC	2	6	127872	127877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510128
2605	NC_013205	TCG	2	6	127906	127911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510128
2606	NC_013205	GAA	2	6	127934	127939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510128
2607	NC_013205	GAG	2	6	128052	128057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510128
2608	NC_013205	GT	3	6	128063	128068	0 %	50 %	50 %	0 %	258510128
2609	NC_013205	GAGC	2	8	128288	128295	25 %	0 %	50 %	25 %	258510129
2610	NC_013205	CAAG	2	8	128303	128310	50 %	0 %	25 %	25 %	258510129
2611	NC_013205	GGT	2	6	128366	128371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510129
2612	NC_013205	AGTC	2	8	128399	128406	25 %	25 %	25 %	25 %	258510129
2613	NC_013205	TCT	2	6	128450	128455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510129
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2615	NC_013205	CGGA	2	8	128467	128474	25 %	0 %	50 %	25 %	258510129
2616	NC_013205	ATGAG	2	10	128518	128527	40 %	20 %	40 %	0 %	258510129
2617	NC_013205	TGC	2	6	128558	128563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510129
2618	NC_013205	TGC	2	6	128588	128593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510129
2619	NC_013205	AAAC	2	8	128610	128617	75 %	0 %	0 %	25 %	258510129
2620	NC_013205	CAA	2	6	128663	128668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510129
2621	NC_013205	ACC	2	6	128806	128811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510129
2622	NC_013205	AGG	2	6	128835	128840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510129
2623	NC_013205	CTG	2	6	128845	128850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510129
2624	NC_013205	GAC	2	6	129107	129112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510130
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2626	NC_013205	TCG	2	6	129172	129177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510130
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2651	NC_013205	CGGA	2	8	130941	130948	25 %	0 %	50 %	25 %	258510131
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2727	NC_013205	GCCGAG	2	12	135208	135219	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258510136
2728	NC_013205	GCA	2	6	135261	135266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510136
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2732	NC_013205	GCTTC	2	10	135463	135472	0 %	40 %	20 %	40 %	258510136
2733	NC_013205	GCT	2	6	135479	135484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510136
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2739	NC_013205	CCA	2	6	135882	135887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510136
2740	NC_013205	ACC	2	6	135902	135907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510136
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2986	NC_013205	CCG	2	6	147284	147289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510150
2987	NC_013205	GC	3	6	147361	147366	0 %	0 %	50 %	50 %	258510150
2988	NC_013205	GGC	2	6	147376	147381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510150
2989	NC_013205	GTC	2	6	147392	147397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510150
2990	NC_013205	GCG	2	6	147401	147406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510150
2991	NC_013205	GGT	2	6	147484	147489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510150
2992	NC_013205	GC	4	8	147512	147519	0 %	0 %	50 %	50 %	258510150
2993	NC_013205	AGC	2	6	147522	147527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510150
2994	NC_013205	TCGC	2	8	147530	147537	0 %	25 %	25 %	50 %	258510150
2995	NC_013205	GAGC	2	8	147812	147819	25 %	0 %	50 %	25 %	258510151
2996	NC_013205	TCT	2	6	147888	147893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510151
2997	NC_013205	CCG	2	6	147894	147899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510151
2998	NC_013205	GGT	2	6	147939	147944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510151
2999	NC_013205	CTT	2	6	147997	148002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510151
3000	NC_013205	TGT	2	6	148022	148027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510151

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